各位临床同仁：

  为进一步提升我院病原感染性疾病的精准诊疗水平，解决传统检测对重度感染、混合感染、罕见病原体检出率低及检测耗时长等问题，临床分子诊断中心现已建立mNGS 病原感染高通量测序检测平台，正式面向全院提供临床检测服务。该项目主要针对血流感染、中枢感染、呼吸系统感染、局灶感染的人群，尤其是重症感染患者及罕见病原菌感染患者，mNGS能够提供快速全谱的病原体鉴定，可以为患者争取靶向用药的时间，减少其他尝试性药物的使用，综合降低患者治疗费用，对于病原感染的早期精准病原鉴定、个体化用药指导及治疗效果评估具有不可替代的关键价值，具体介绍如下：

一、疾病背景与检测意义

  病原感染是呼吸内科、重症医学科、感染科、神经内外科、骨科、血液内科、儿科等科室的常见病症，其致病原涵盖细菌、真菌、病毒、寄生虫等多种病原体，临床诊疗面临明确挑战：

  传统检测局限：病原体培养周期长达 3-7 天，易延误急性期治疗；免疫学检测及传统的PCR技术仅覆盖少数常见病原，对罕见病原及混合感染漏诊率高，且免疫学检测存在窗口期，假阴性高。

  诊疗需求迫切：免疫功能低下患者（如老年人、肿瘤放化疗患者）、重症感染患者、特殊病原感染患者需快速明确病原，避免盲目使用广谱抗生素导致耐药性增加。

  技术优势明显：mNGS 病原感染高通量测序可检测细菌（10989种）、真菌（1179种）、病毒（5050种）、寄生虫（282种）等两万种病原体，显著提高病原诊断阳性率，指导临床靶向使用抗生素，为临床精准诊疗提供直接、快速的证据支撑。

二、检测项目简介

1. 检测项目名称：病原宏基因检测。根据感染部位及样本类型分为血源感染宏基因检测、神经系统感染宏基因检测、呼吸系统感染宏基因检测、局灶感染宏基因检测以及多部位感染宏基因检测。

2. 检测目的：体外定量 / 定性检测各种来源样本中病原体核酸，明确感染的具体病原类型，为临床诊断提供依据。

3. 检测方法：高通量二代测序技术。

三、报告周期

每日12点前样本，隔日上午出报告。

四、标本采集要求

五、送检流程

1. 开具医嘱：医生在门诊海泰系统中根据需要开具“（血源、神经系统、呼吸系统、局灶感染、多部位）感染宏基因检测”检验申请单，患者门诊缴费。

2. 标本采集：采集方法与微生物检验标本相同，具体请遵照临床分子诊断中心《样本采集手册》 执行。

3. 标本运送： 本中心收样人员去临床科室和气管镜室收取样本。

4. 标本接收： 中心人员核对标本信息无误后，进行签收、登记、前处理及上机检测。

5. 报告审核与发布： 结果经二级审核后，上传PACS系统，临床医生可查阅电子报告。

结语：

  mNGS病原感染高通量测序检测技术的引入和开展，将显著增强我院在感染性疾病诊断领域的精准检测与分析能力。该技术通过大规模平行测序，能够无偏倚地检测样本中可能存在的各类病原体核酸序列，从而实现对细菌、病毒、真菌及寄生虫等的全面筛查，帮助临床医生在更短时间内准确识别感染病原体，为患者争取宝贵的治疗时间。此外，也能有效避免经验性用药带来的不确定性，进而显著减少广谱抗生素的滥用情况，降低耐药菌的产生与传播风险，最终提升感染性疾病的诊疗水平和医疗质量。

如有任何疑问，请联系临床分子诊断中心。联系电话：0719-8801867

临床分子诊断中心

2022年12月12日